MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 25033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011988	A	6	6	50174	50179	100 %	0 %	0 %	0 %	222106174
1002	NC_011988	TCC	2	6	50180	50185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106174
1003	NC_011988	CCGGC	2	10	50276	50285	0 %	0 %	40 %	60 %	222106174
1004	NC_011988	ACG	2	6	50306	50311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106174
1005	NC_011988	TGG	2	6	50316	50321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106174
1006	NC_011988	CGA	2	6	50340	50345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106174
1007	NC_011988	GCG	2	6	50348	50353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106174
1008	NC_011988	GGC	2	6	50362	50367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106174
1009	NC_011988	TGA	2	6	50373	50378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106174
1010	NC_011988	CGA	2	6	50412	50417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106174
1011	NC_011988	GCG	2	6	50419	50424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106174
1012	NC_011988	AGG	2	6	50430	50435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106174
1013	NC_011988	GCC	2	6	50572	50577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106174
1014	NC_011988	GC	3	6	50615	50620	0 %	0 %	50 %	50 %	222106174
1015	NC_011988	GCA	2	6	50685	50690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106174
1016	NC_011988	ATC	2	6	50711	50716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106174
1017	NC_011988	CAC	2	6	50782	50787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106174
1018	NC_011988	TCC	2	6	50816	50821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106174
1019	NC_011988	CGC	2	6	50928	50933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106174
1020	NC_011988	CAT	2	6	51052	51057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106174
1021	NC_011988	TCG	2	6	51086	51091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106174
1022	NC_011988	CTTG	2	8	51133	51140	0 %	50 %	25 %	25 %	222106174
1023	NC_011988	TG	3	6	51215	51220	0 %	50 %	50 %	0 %	222106175
1024	NC_011988	CGA	2	6	51250	51255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106175
1025	NC_011988	ATG	2	6	51267	51272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106175
1026	NC_011988	CAG	2	6	51278	51283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106175
1027	NC_011988	CAG	2	6	51308	51313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106175
1028	NC_011988	GCA	2	6	51381	51386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106175
1029	NC_011988	GCC	2	6	51447	51452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106175
1030	NC_011988	GCA	2	6	51466	51471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106175
1031	NC_011988	GCA	2	6	51637	51642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106175
1032	NC_011988	CAG	2	6	51728	51733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106175
1033	NC_011988	CGT	2	6	51782	51787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106175
1034	NC_011988	CGGT	2	8	51822	51829	0 %	25 %	50 %	25 %	222106175
1035	NC_011988	CAG	2	6	51863	51868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106175
1036	NC_011988	AGG	2	6	51883	51888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106175
1037	NC_011988	GAT	2	6	51902	51907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106175
1038	NC_011988	GCT	2	6	52014	52019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106175
1039	NC_011988	CGG	2	6	52027	52032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106175
1040	NC_011988	GAT	2	6	52037	52042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106175
1041	NC_011988	CAG	2	6	52092	52097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106176
1042	NC_011988	CGA	2	6	52160	52165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106176
1043	NC_011988	CAG	3	9	52197	52205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106176
1044	NC_011988	GCG	2	6	52330	52335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106176
1045	NC_011988	GCT	2	6	52397	52402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106176
1046	NC_011988	GCC	2	6	52407	52412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106176
1047	NC_011988	CGA	2	6	52514	52519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106176
1048	NC_011988	CAT	2	6	52587	52592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106176
1049	NC_011988	GTCCG	2	10	52596	52605	0 %	20 %	40 %	40 %	222106176
1050	NC_011988	GGC	2	6	52619	52624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106176
1051	NC_011988	GCC	2	6	52662	52667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106176
1052	NC_011988	CAG	2	6	52677	52682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106176
1053	NC_011988	AGC	2	6	52711	52716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106176
1054	NC_011988	CAG	2	6	52770	52775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106176
1055	NC_011988	GCG	2	6	52820	52825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106176
1056	NC_011988	CGG	2	6	52853	52858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106176
1057	NC_011988	CAG	2	6	52859	52864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106176
1058	NC_011988	CAT	2	6	52872	52877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106176
1059	NC_011988	GGCGC	2	10	53056	53065	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1060	NC_011988	ATA	2	6	53102	53107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106177
1061	NC_011988	TCA	2	6	53218	53223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106177
1062	NC_011988	TCA	2	6	53235	53240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106177
1063	NC_011988	TCTT	2	8	53295	53302	0 %	75 %	0 %	25 %	222106177
1064	NC_011988	CTT	2	6	53317	53322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106177
1065	NC_011988	TGG	3	9	53374	53382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106177
1066	NC_011988	GAA	2	6	53384	53389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106177
1067	NC_011988	GAT	2	6	53414	53419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106177
1068	NC_011988	GCT	2	6	53452	53457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106177
1069	NC_011988	GCG	2	6	53479	53484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106177
1070	NC_011988	CGC	2	6	53525	53530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106177
1071	NC_011988	TCG	2	6	53586	53591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106177
1072	NC_011988	GCC	2	6	53607	53612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106177
1073	NC_011988	TGA	2	6	53743	53748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106177
1074	NC_011988	AGA	2	6	53787	53792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106177
1075	NC_011988	CCGGTA	2	12	53796	53807	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222106177
1076	NC_011988	GAC	2	6	53810	53815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106177
1077	NC_011988	CAG	2	6	53831	53836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106177
1078	NC_011988	GC	3	6	53848	53853	0 %	0 %	50 %	50 %	222106177
1079	NC_011988	GCT	3	9	53904	53912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106177
1080	NC_011988	GGT	2	6	53990	53995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106177
1081	NC_011988	CCG	2	6	54054	54059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_011988	TCC	2	6	54079	54084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_011988	TCA	2	6	54129	54134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_011988	TTG	2	6	54145	54150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011988	CGC	2	6	54205	54210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_011988	TC	3	6	54211	54216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_011988	ATGG	2	8	54302	54309	25 %	25 %	50 %	0 %	222106178
1088	NC_011988	GAACG	2	10	54316	54325	40 %	0 %	40 %	20 %	222106178
1089	NC_011988	ATCGAT	2	12	54554	54565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222106178
1090	NC_011988	ATCG	2	8	54595	54602	25 %	25 %	25 %	25 %	222106178
1091	NC_011988	CTGA	2	8	54623	54630	25 %	25 %	25 %	25 %	222106178
1092	NC_011988	CA	3	6	54694	54699	50 %	0 %	0 %	50 %	222106178
1093	NC_011988	CGA	2	6	54791	54796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106178
1094	NC_011988	GCG	2	6	54820	54825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106178
1095	NC_011988	GAT	2	6	54866	54871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106178
1096	NC_011988	ATC	2	6	54959	54964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106178
1097	NC_011988	TCA	2	6	54969	54974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106178
1098	NC_011988	TTGG	2	8	55062	55069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011988	CGT	2	6	55078	55083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_011988	TCG	2	6	55118	55123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_011988	GCG	2	6	55241	55246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_011988	GTT	2	6	55374	55379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011988	GAA	2	6	55393	55398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011988	GTC	2	6	55404	55409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_011988	GA	3	6	55417	55422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011988	GCT	2	6	55478	55483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106179
1107	NC_011988	CGAAGC	2	12	55558	55569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106179
1108	NC_011988	GTC	2	6	55601	55606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106179
1109	NC_011988	TGG	2	6	55657	55662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106179
1110	NC_011988	TGA	2	6	55777	55782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106179
1111	NC_011988	TGGG	2	8	55820	55827	0 %	25 %	75 %	0 %	222106179
1112	NC_011988	G	6	6	55975	55980	0 %	0 %	100 %	0 %	222106179
1113	NC_011988	CGA	2	6	56032	56037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106179
1114	NC_011988	TGA	2	6	56089	56094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106179
1115	NC_011988	CGC	2	6	56111	56116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106179
1116	NC_011988	ATG	2	6	56204	56209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106179
1117	NC_011988	CCTT	2	8	56308	56315	0 %	50 %	0 %	50 %	222106179
1118	NC_011988	GTT	2	6	56348	56353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106179
1119	NC_011988	CGAT	2	8	56514	56521	25 %	25 %	25 %	25 %	222106179
1120	NC_011988	ATG	2	6	56522	56527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106179
1121	NC_011988	TTC	2	6	56542	56547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106179
1122	NC_011988	GAA	2	6	56560	56565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106179
1123	NC_011988	GCC	2	6	56633	56638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106179
1124	NC_011988	GCC	2	6	56668	56673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106179
1125	NC_011988	A	6	6	56742	56747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011988	TGT	2	6	56759	56764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1236	NC_011988	T	6	6	62261	62266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1237	NC_011988	TGTAA	2	10	62281	62290	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1238	NC_011988	GCA	2	6	62377	62382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106185
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1249	NC_011988	CTC	2	6	63002	63007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106185
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1252	NC_011988	CGT	2	6	63151	63156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106185
1253	NC_011988	TCC	2	6	63299	63304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106185
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1255	NC_011988	TCG	2	6	63559	63564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_011988	TGG	2	6	63587	63592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_011988	GC	3	6	63594	63599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1258	NC_011988	GCA	2	6	63632	63637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1291	NC_011988	GC	3	6	65713	65718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1499	NC_011988	TA	3	6	78136	78141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_011988	GCAC	2	8	78153	78160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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